Comenzaré comentándote que este módulo (pues de eso se trata, de un módulo), funciona conjuntamente con el Componente "banners" que debes tener instalado en tu Joomla, y configurado convenientemente:

    En él habrá configurado como sabes, el apartado "clients" y el de "gestión de banners":  

   Suponiendo que tienes todo esto bien, deberás ahora instalar el módulo que te adjunto, como cualquier otro Módulo en Joomla:

    descargar desde aquí, mod_banner_popup

   Una vez instalado, te vas a la zona de los Módulos y:

picas sobre el recién instalado, con lo que te aparecerá:

es decir, ya lo tienes; ahora picas sobre él y saldrá:

que configuras convenientemente (título, publicar: SI, ancho: 468, Alto: 140 (en mi caso porque le pongo 2 banners, si fuese uno solo, bastaba con 70 por ejemplo), Posición: 245 (píxeles desde la izquierda, es decir, centrado)) y lo guardamos.

   Y será en el Componente "banners" donde deberemos colocar el código suministrado por nuestro afiliador, para que se muestre/n el/los banner/s.

   Eso es todo, una vez guardado te aparecerá la ventanita popup con los banners, tal como ves en mi web: